Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tulp4Q9JIL5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tulp4Q9JIL5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tulp4Q9JIL5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms