Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms