Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
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