Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tspan4Q9DCK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tspan4Q9DCK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tspan4Q9DCK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tspan4Q9DCK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tspan4Q9DCK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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