Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cpne8Q9DC53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms