Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde1Q9DBZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms