Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ribc1Q9D0B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms