Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
3100002H09RikQ9CXW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms