Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma8Q9CWH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma8Q9CWH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms