Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Commd4Q9CQ02 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Commd4Q9CQ02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms