Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl17Q9CPR4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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