Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll1Q99NC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll1Q99NC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms