Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ALS2Q96Q42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALS2Q96Q42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms