Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssuh2Q8C3L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssuh2Q8C3L1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssuh2Q8C3L1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms