Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D130040H23RikQ8BII3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms