Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2bQ80ZJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 458.1 ms