Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcph1Q7TT79 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcph1Q7TT79 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms