Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd1l2Q7TN88 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd1l2Q7TN88 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms