Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GcsamQ6RFH4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GcsamQ6RFH4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GcsamQ6RFH4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms