Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudcd1Q6PIP5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd1Q6PIP5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms