Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp4Q62445 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sp4Q62445 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms