Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne1Q61457 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne1Q61457 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms