Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kpna1Q60960 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna1Q60960 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms