Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PfasQ5SUR0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms