Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc185Q3V118 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc185Q3V118 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms