Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbof1Q3V079 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms