Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhdc9Q3USL1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhdc9Q3USL1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms