Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hvcn1Q3U2S8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms