Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Hbq1bQ3U0A6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Hbq1bQ3U0A6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Hbq1bQ3U0A6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Hbq1bQ3U0A6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Hbq1bQ3U0A6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Hbq1bQ3U0A6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbq1bQ3U0A6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hbq1bQ3U0A6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hbq1bQ3U0A6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hbq1bQ3U0A6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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