Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arhgap9Q1HDU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap9Q1HDU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap9Q1HDU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms