Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A3Q14050 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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