Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col19a1Q0VF58 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms