Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cntn3Q07409 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cntn3Q07409 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn3Q07409 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms