Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Larp7Q05CL8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Larp7Q05CL8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms