Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcn1Q05186 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rcn1Q05186 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rcn1Q05186 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms