Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CkbQ04447 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CkbQ04447 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CkbQ04447 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CkbQ04447 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms