Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme2Q01768 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms