Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flt3Q00342 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flt3Q00342 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flt3Q00342 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flt3Q00342 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flt3Q00342 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flt3Q00342 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flt3Q00342 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms