Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PctpP53808 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PctpP53808 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PctpP53808 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PctpP53808 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PctpP53808 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PctpP53808 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PctpP53808 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PctpP53808 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PctpP53808 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PctpP53808 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PctpP53808 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PctpP53808 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PctpP53808 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PctpP53808 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PctpP53808 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PctpP53808 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PctpP53808 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PctpP53808 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PctpP53808 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PctpP53808 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PctpP53808 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PctpP53808 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PctpP53808 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PctpP53808 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms