Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTBP53611 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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