Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpargP37238 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpargP37238 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpargP37238 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpargP37238 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpargP37238 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpargP37238 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpargP37238 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpargP37238 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpargP37238 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpargP37238 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpargP37238 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpargP37238 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms