Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab17P35292 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab17P35292 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab17P35292 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab17P35292 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab17P35292 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms