Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp2P29594 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp2P29594 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp2P29594 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp2P29594 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms