Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd9P28357 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms