Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja8P28236 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms