Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra2P26048 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms