Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fcer1aP20489 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms