Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms