Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms