Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxc9P09633 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms